MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 25914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	AGA	2	6	30	35	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017285	CAG	2	6	46	51	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017285	TTG	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448989
4	NC_017285	GAA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448989
5	NC_017285	TG	3	6	208	213	0 %	50 %	50 %	0 %	384448989
6	NC_017285	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448989
7	NC_017285	TGA	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
8	NC_017285	CTC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384448989
9	NC_017285	A	6	6	329	334	100 %	0 %	0 %	0 %	384448989
10	NC_017285	AC	3	6	387	392	50 %	0 %	0 %	50 %	384448989
11	NC_017285	ATG	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
12	NC_017285	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
13	NC_017285	ATG	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
14	NC_017285	CTT	2	6	601	606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448989
15	NC_017285	A	6	6	660	665	100 %	0 %	0 %	0 %	384448989
16	NC_017285	TCT	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448989
17	NC_017285	GAG	3	9	723	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448989
18	NC_017285	CAA	2	6	864	869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448989
19	NC_017285	GGTT	2	8	870	877	0 %	50 %	50 %	0 %	384448989
20	NC_017285	AG	3	6	919	924	50 %	0 %	50 %	0 %	384448989
21	NC_017285	ATT	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448989
22	NC_017285	GAA	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017285	A	6	6	1013	1018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017285	CAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448990
25	NC_017285	AAT	2	6	1259	1264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448990
26	NC_017285	GA	3	6	1332	1337	50 %	0 %	50 %	0 %	384448990
27	NC_017285	AAC	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448990
28	NC_017285	TTG	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448990
29	NC_017285	TAAT	2	8	1495	1502	50 %	50 %	0 %	0 %	384448990
30	NC_017285	GATT	2	8	1528	1535	25 %	50 %	25 %	0 %	384448990
31	NC_017285	AGCT	2	8	1546	1553	25 %	25 %	25 %	25 %	384448990
32	NC_017285	GTA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448990
33	NC_017285	TTC	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448990
34	NC_017285	CTT	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448990
35	NC_017285	GTAG	2	8	1806	1813	25 %	25 %	50 %	0 %	384448990
36	NC_017285	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448990
37	NC_017285	AG	3	6	1918	1923	50 %	0 %	50 %	0 %	384448990
38	NC_017285	TGA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448990
39	NC_017285	TC	3	6	1983	1988	0 %	50 %	0 %	50 %	384448990
40	NC_017285	GTT	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448990
41	NC_017285	GA	3	6	2085	2090	50 %	0 %	50 %	0 %	384448990
42	NC_017285	ATG	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448990
43	NC_017285	CGT	2	6	2175	2180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448990
44	NC_017285	ACT	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448990
45	NC_017285	TTCA	2	8	2466	2473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017285	T	8	8	2509	2516	0 %	100 %	0 %	0 %	384448991
47	NC_017285	T	8	8	2521	2528	0 %	100 %	0 %	0 %	384448991
48	NC_017285	TTTTG	2	10	2542	2551	0 %	80 %	20 %	0 %	384448991
49	NC_017285	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448991
50	NC_017285	GCCA	2	8	2656	2663	25 %	0 %	25 %	50 %	384448991
51	NC_017285	GA	3	6	2672	2677	50 %	0 %	50 %	0 %	384448991
52	NC_017285	ATT	2	6	2688	2693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448991
53	NC_017285	CTGT	2	8	2726	2733	0 %	50 %	25 %	25 %	384448991
54	NC_017285	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	384448991
55	NC_017285	AGG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448991
56	NC_017285	TAT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448991
57	NC_017285	TAT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448991
58	NC_017285	T	6	6	2897	2902	0 %	100 %	0 %	0 %	384448991
59	NC_017285	CAT	2	6	2931	2936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017285	TAT	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017285	ATT	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017285	AGA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
63	NC_017285	GAG	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448992
64	NC_017285	TTG	2	6	3143	3148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
65	NC_017285	AAAGT	2	10	3160	3169	60 %	20 %	20 %	0 %	384448992
66	NC_017285	CGT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448992
67	NC_017285	A	6	6	3227	3232	100 %	0 %	0 %	0 %	384448992
68	NC_017285	TTC	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
69	NC_017285	AATT	2	8	3266	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	384448992
70	NC_017285	T	6	6	3304	3309	0 %	100 %	0 %	0 %	384448992
71	NC_017285	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
72	NC_017285	GTT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
73	NC_017285	T	6	6	3429	3434	0 %	100 %	0 %	0 %	384448992
74	NC_017285	ATGCAT	2	12	3436	3447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384448992
75	NC_017285	CAG	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448992
76	NC_017285	TTTC	2	8	3563	3570	0 %	75 %	0 %	25 %	384448992
77	NC_017285	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384448992
78	NC_017285	ACG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448992
79	NC_017285	AGTT	2	8	3737	3744	25 %	50 %	25 %	0 %	384448992
80	NC_017285	GGT	2	6	3776	3781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448992
81	NC_017285	CTAAGA	2	12	3791	3802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384448992
82	NC_017285	TC	3	6	3932	3937	0 %	50 %	0 %	50 %	384448992
83	NC_017285	TTA	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448992
84	NC_017285	TAA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448992
85	NC_017285	AG	3	6	4058	4063	50 %	0 %	50 %	0 %	384448992
86	NC_017285	CTT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
87	NC_017285	TA	3	6	4117	4122	50 %	50 %	0 %	0 %	384448992
88	NC_017285	AGA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
89	NC_017285	GTC	2	6	4148	4153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448992
90	NC_017285	TTG	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
91	NC_017285	CTTC	2	8	4217	4224	0 %	50 %	0 %	50 %	384448992
92	NC_017285	CAA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448992
93	NC_017285	TTC	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
94	NC_017285	ACC	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448992
95	NC_017285	TA	3	6	4286	4291	50 %	50 %	0 %	0 %	384448992
96	NC_017285	AAAGA	2	10	4329	4338	80 %	0 %	20 %	0 %	384448992
97	NC_017285	ATG	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448992
98	NC_017285	TGTT	2	8	4379	4386	0 %	75 %	25 %	0 %	384448992
99	NC_017285	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	384448992
100	NC_017285	ACT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448992
101	NC_017285	TGG	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448992
102	NC_017285	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448992
103	NC_017285	TCCC	2	8	4588	4595	0 %	25 %	0 %	75 %	384448992
104	NC_017285	ATTACT	2	12	4608	4619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384448992
105	NC_017285	CCA	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448992
106	NC_017285	TCT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
107	NC_017285	GTT	2	6	4681	4686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
108	NC_017285	A	6	6	4698	4703	100 %	0 %	0 %	0 %	384448992
109	NC_017285	AGA	3	9	4719	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
110	NC_017285	TTG	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
111	NC_017285	AGAGA	2	10	4881	4890	60 %	0 %	40 %	0 %	384448992
112	NC_017285	AAG	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
113	NC_017285	GAA	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
114	NC_017285	CTTT	2	8	5077	5084	0 %	75 %	0 %	25 %	384448992
115	NC_017285	GAA	2	6	5115	5120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
116	NC_017285	AAGGA	2	10	5144	5153	60 %	0 %	40 %	0 %	384448992
117	NC_017285	GAA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
118	NC_017285	CAA	2	6	5223	5228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017285	TTG	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017285	A	6	6	5275	5280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017285	AATC	2	8	5302	5309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017285	AT	3	6	5332	5337	50 %	50 %	0 %	0 %	384448993
123	NC_017285	T	7	7	5341	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	384448993
124	NC_017285	CGG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384448993
125	NC_017285	GAA	3	9	5513	5521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448993
126	NC_017285	AGATG	2	10	5566	5575	40 %	20 %	40 %	0 %	384448993
127	NC_017285	AGG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448993
128	NC_017285	CTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448993
129	NC_017285	TC	3	6	5739	5744	0 %	50 %	0 %	50 %	384448993
130	NC_017285	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448993
131	NC_017285	GAAG	2	8	5827	5834	50 %	0 %	50 %	0 %	384448993
132	NC_017285	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448993
133	NC_017285	GAAA	2	8	5932	5939	75 %	0 %	25 %	0 %	384448993
134	NC_017285	T	6	6	5954	5959	0 %	100 %	0 %	0 %	384448993
135	NC_017285	GCT	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448993
136	NC_017285	TCA	2	6	6056	6061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448993
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138	NC_017285	AGA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448993
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402	NC_017285	AAG	2	6	17739	17744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384449000
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444	NC_017285	A	6	6	19566	19571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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